广东省数据知识产权存证登记平台
登记信息
AAV9病毒变体包装能力文库 已登记
  • 数据登记申请号:

    粤2024010500154

  • 关键词:

    AAV9变体、包装能力

  • 登记时间:

    2024-01-16

  • 平台证书编号:

    440106CM750032401001

  • 数据证书:

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  • 第三方专业服务机构出具的合规评估报告:

    暂无

  • 法院编号:

    广州互联网法院 - 7e4dc6b10a5cc0691425523af01f8f63d241b8510b3696856812c74429c1b980-749fc1a4;legalxchain

区块链信息
  • 上链时间:

    2024-01-08

  • 所属区块链:

    司法联盟链·广东省知识产权保护中心

  • 证据指纹:

    b3ce91565833ebe7209ae3255656cd804908e2c4ae9ef420892d28b97d755c831cafecb5f064758f38cd749a4cdf6c406af19231bae0e5bfa8ce2d6ce7902659

  • 区块链存证证书编号:

    LXM-GDIPI-23202401086263017103

数据信息
数据简介
AAV9病毒变体包装能力文库,是包含约31.6万种AAV9变体的衣壳序列及其包装能力分数的病毒文库。文库的设计方式是,在野生型AAV9衣壳蛋白587~588位点之间插入7~10个氨基酸的随机多肽片段,依次进行序列合成、质粒构建和测序、病毒包装和测序、并用自研的方法分析测序数据,从而得到该文库。文库数据包含AAV9病毒变体的碱基序列、氨基酸序列、质粒读数以及RPM、病毒读数以及RPM、包装能力评分等。
  • 数据来源:

    自行产生

  • 数据所属行业分类:

    M75 科技推广和应用服务业

数据处理规则说明
对质粒库进行二代测序,分析测序结果,得到每条变体序列的读数,进而计算RPM值;对病毒库进行二代测序,分析测序结果,得到每条变体序列的读数,进而计算RPM值。整合质粒、病毒的RPM值,得到每个AAV变体的包装能力分数。 若存在多组病毒库重复实验,则对多组病毒库测算出来的包装能力分数,在每一条变体的层面取均值。
应用场景描述
基因治疗(gene therapy)是指将外源正常基因导入靶细胞,以纠正或代偿基因缺陷和异常引起的疾病,最终达到治疗目的的一种生物治疗方法。将外源正常基因导入靶细胞的工具称为基因治疗载体。基因治疗载体分为两大类:病毒载体(主要包括慢病毒、腺病毒、逆转录病毒、腺相关病毒等),非病毒载体(主要包括裸露DNA、脂质体、纳米载体等)。其中,腺相关病毒(AAV)是目前发现的一类结构最简单的单链DNA缺陷型病毒,需要辅助病毒(通常为腺病毒)参与复制,由于其安全性好、宿主细胞范围广、免疫源性低,在体内表达外源基因时间长等特点,被视为最有前途的基因治疗载体,在世界范围内的基因治疗和疫苗研究中得到广泛应用。然而,在AAV药物产业化阶段,因为给药浓度通常较高,意味着一次治疗所需的病毒载体量也更大,需要更高的成本,这也是为什么基因治疗药物的价格如何昂贵的原因之一。为了提高药物的可及性,进一步降低成本,提高AAV病毒载体的产量成为了最严峻的挑战之一。 本文库诞生之后,利用数据可分析得到提高包装能力的关键motif、建立预测包装能力AI模型、设计高包装能力的新AAV病毒等,加速研发和生产的高包装能力AAV病毒变
  • 数据格式:

    excel

  • 数据更新频率:

    其他

  • 数据量(万):

    31.5747

样例数据
seq:ACCGGTGTGGCGCCGAGTAAGGATTGGGGGCTCAGC;p_reads:417;p_db_reads:133050115;p_seed_rpm:3.1342;v_reads:1611;v_db_reads:70135039;v_seed_rpm:22.97;aa:TGVAPSKDWGLS;score:2.87358170740156
数据结构样例
病毒包装性能.csv seq:AAV病毒的碱基序列 aa:AAV病毒的氨基酸序列 p_reads:质粒读数 p_db_reads:文库总质粒读数 p_seed_rpm:质粒RPM v_reads:病毒读数 v_db_reads:文库总病毒读数 v_seed_rpm:病毒RPM Score:AAV病毒包装能力
数据状态
  • 2024-01-16

    数据知识产权登记完成